第三章
畫面回到第一章結尾，夏目向主角說明一切後邀請他加入妖怪偵探團，雖然劇情有點驚嚇但是為了拯救世界主角加入了。由於到了未來世界，所以原來的妖怪徽章也變了樣子（成了鑰匙狀，地縛貓吐槽自己種族的心心不見了），為了驗證新的徽章能不能召喚，主角演示一下發現地縛貓的種族都變了，不過無論變成什麼種族召喚還是以前一樣就好了。接下來可以調查附近的妖怪，首先前往偵探團本部-アキノリ的房子（穿過サクラギビルズ的那頭一個叫香住台的地方）。
跟著提示來到香住台アキノリ的房子，原來這裡就是妖怪偵探團事務所，接著アキノリ的奶奶進來（等下，自行車是借給這位老奶奶？）跟大家打招呼，知道主角是從過去來的，アキノリ想讓主角回去之前都在這裡住下，奶奶也很樂意答應了（奶奶說：當作自己家就好了）。另外怎麼從未來打開那扇門，奶奶也在調查，如果有什麼消息會通知アキノリ。
奶奶走後大家商議，既然主角住的地方定了下來，接著該調查怪奇事件了。アキノリ在網上查了下，接下來的怪奇事件都是在半夜發生的，要半夜出門被家人知道可不行（主角以為未來的自己會允許女兒半夜出門，其實根本不行）。這時主角想起在前代用過的辦法，利用バク製造一個假的自己留在家裡睡覺，大家認可這個方案後決定先回夏目家。
夏目帶著バク回到家裡，上樓調查床以後バク出來解釋怎麼讓爸媽不知道自己半夜出門（變成夏目的樣子睡覺），但是要先設置好起床時間才能睡哦。另外由於バク除了食夢以外還會吃掉人的疲勞，所以即使夏目晚上出去第二天也不會困的。再次調查床，選擇第三項設置起床時間為0點（明日午前0點）然後選“はい”就行。接著半夜起來，バク變成自己的樣子，家裡人都睡了，向公園出發吧。
來到公園發生劇情，夥伴們都覺得主角能和バク成為夥伴不愧是傳說中的手錶使用者，接著開始調查怪奇事件（夏目身上好像有奇怪的光但主角懷疑自己看錯了）。接下來的怪氣事件可以在偵探事務所的電腦上或者任務功能表接受委託。
1、真夜中の果たし狀
第一個事件，跟著提示來到目的地後得知男子聽到附近有聲音“來決鬥吧”，但是又看不到人，用手資料表掃描看看。
掃描後找到一扇不可思議的門，聲音是從裡面傳出的。正在想怎麼開門時，後面的男孩把附近撿到的鑰匙交了出來（男孩膽子夠大的）。
開門後來到一個異世界，這門是アークのトビラ，可以進入裡世界，而且這裡的妖怪都非常兇暴，所以要特別小心（以後獲得各種 鑰匙後來到這個門前調查可以選擇不同的鑰匙進入，比如會有某些鑰匙是某個種族的進去則只會遇到某個種族，還有特殊的鑰匙等等）。
跟著右下角地圖提示可以找到一個妖怪（這裡會有到處遊走的妖怪可以打打練級），上前對話會進入戰鬥（對於沒練級的話挺強的）。
將其打敗後它變回了可愛的模樣，原來它為了成為最強的妖怪正在修行，在裡世界可以有不少對手，接著新增“アーク聯動”功能。夥伴們以為是這個妖怪變成剛才遞鑰匙的男子故意引導他們進入裡世界的，但似乎不是這樣，普通人類是看不到進來的那一扇門的（差點暴露手錶使用者的身份），大家趕緊轉移話題離開裡世界（番長也答應以後小聲點不讓外面的時間聽見）。為了回到原來的世界，要自行回到門所在的位置（路癡可要記得路哦）。
2、ミッドナイト熱血魔人
接受這個委託的時候天氣正好下雨，任務要求是天氣晴朗的深夜，只能先回家調查床上設置起來的時間還是0點即可（右下角地圖有天氣，要看到沒下雨才行，如果一直下雨則不停繼續睡）（之前有將家裡設置成指標目標的話直接開引導自己走回家裡就行）。
跟著提示來到任務地點，原來是男孩的哥哥是個身體很好的運動員，在比賽前忽然病倒了，所以男孩仔細調查後發現與熱血魔人的傳說有關，雖然現在哥哥在回復中（在タプタプ池周圍散步），但如果傷痛治好了再被熱血魔人盯上的話。雖然男孩想哥哥再次參加比賽，但是這樣追查可能會讓他受傷，偵探團接下任務調查這件事讓男孩回家去了。
接著在附近掃描發現妖氣污染，清除污染會找到“メラメライオン-熱血獅子”，將其擊敗後會變回原樣，原來他影響了男性體育選手導致選手過分熱血練習過度而受傷。接著一群人研究了半天，經維斯帕提醒（維斯帕偶爾還是挺靠譜的！）最後決定帶著熱血獅子去找選手，而熱血獅子也想給選手道歉。至於誰是這位選手嘛-當然是剛才的哥哥了。
跟著提示來到池邊，熱血獅子已經先到了，夏目假裝自己是記者要給運動選手採訪，問能不能接受採訪（トウマ：主角是你的大粉絲哦）。首先問的是傷痛恢復情況，腳傷基本都恢復了（選手哥哥對自己這種不厲害的選手也有粉絲十分高興），受傷的時候雖然弟弟很支持哥哥，但是他還是沒有自信想引退了，之後恢復到能走發現自己小學以來很少對能走路那麼開心，而且漸漸在恢復得可以走快一點了。被問到如果是因為熱血魔人的原因導致受傷會不會怨恨熱血魔人，哥哥表示不會，而且按照現在的恢復速度秋天的比賽應該來得及，下次出場一定能拿到優勝（最後熱血獅子又附身到了哥哥身上，雖然哥哥馬上跑回去休息，但總有點擔心呀）。最後熱血獅子會加入成為夥伴（差點要附身アキノリ，哈哈）。
1、漆黒に染まりし闇夜を抱く赤き焰竜
這個任務同樣要求天氣晴朗的哦
根據提示來到目的地，沒有發現傳言中的紅龍，トウマ在地上撿到一張遊戲卡牌，是一張卡牌遊戲“電光火石時代”中的超傳說級怪物卡（全世界只有3張，會選擇持有人的夢幻卡），是在冰場地上最強的卡牌，被稱為“雪原的帝王”或“冰雪的銀狼”，特殊能力是能連續攻擊3回，技能是令對手最多5回合不能行動（等下，為何要解釋這麼清楚）。眾人不明覺厲，反正就是張很厲害的卡牌，至於為何會掉落在這裡，可能是因為持有者被紅龍襲擊不小心掉的，可能持有者會回來找，所以白天再過來看看。
先跑回家（這裡沒有引導，要記得怎麼走哦），到家後調查床，選擇第一項。
白天起床後會有提示，跟著提示走就行。來到目的地果然看到弟弟在幫著朋友找超稀有的卡牌，將卡牌交給旁邊的小孩後得知他因為去便利店買東西回來的路上被紅龍給~但是小孩不要卡牌了之後說了一堆卡牌的設定問題（聽不懂啊！！只有トウマ才能聽懂吧）。動畫“電光火石時代”18話所說，當“冰雪的銀狼”蘇醒時，“炎獄的赤龍”也從深眠中蘇醒。所以入手這張卡牌的人必然要和“炎獄的赤龍”戰鬥，這是被卡牌選中者的命運。男孩因為見到赤龍就逃跑，所以已經失去持有資格了，但他委託夏目代替他打倒“炎獄的赤龍”（所以要再次半夜來這裡）。
再次跑回家（依然沒有引導），調查床選擇第三項，0點起床。
跟著提示來到目的地，掃描出紅龍後調查進入戰鬥。
打敗紅龍後發現弟弟也跟了過來，並且得知主角是自己小時候的爸爸（震驚臉）。雖然夏目有バク頂替，弟弟可沒有啊，萬一被發現就完蛋了，所以趕緊回去吧。弟弟走後過來一條小紅龍，原來是它變成紅龍襲擊男孩，但它也是因為被黑箭射中才變成那樣的，之後他變成襲擊自己的妖怪的樣子，果然是在學校襲擊他們的~由於襲擊男孩不是小妖怪的本意，並且能看到“炎獄的赤龍”的樣子トウマ一臉滿足。最後小妖怪加入，事件解決。
酒吞：人類居然持有フドウ雷鳴剣，所有的妖聖劍都應該為了鬼族而存在的。トウマ還沒能發揮フドウ雷鳴剣的力量所以他們要趁早搶過來，但是夏目和忽然出現的主角是個麻煩，這次倆個手下都要一起過來搶劍了。
第二天，大家還在為解決了晚上的事件而高興，アキノリ的奶奶忽然來電話，以為バク的事情暴露了，其實是非常重要的緊急事件，趕緊一起前往アキノリ家吧。
原來因為主角來未來世界事件太長，導致弟弟身體正在消失，反應過來夏目也開始消失了。為了讓主角回去原來的世界，奶奶拿出家族先祖就準備好給穿越時空者的鑰匙，“キズナをつなぐ者”的意思是主角必須回去過去與未來的這些孩子有羈絆的人見面，找出這些有羈絆的人就可以拯救這些孩子，趕緊出發去公園的門回到過去吧。
來到公園調查門即可回到現代，但是要怎麼找出羈絆之人主角只是個小學生完全沒頭緒，アキノリ建議先從認識的人裡面找吧。
跟著提示先找到クマ和カンチ，クマ邀請主角去カンチ家裡玩遊戲，心想這兩個可能會是要找的人所以要求認真看看他們的臉（他們以為主角要玩閉氣看誰先笑的遊戲），夏目表示這兩位“叔叔”在自己小的時候經常和她玩，雖然他們和主角關係很好但不是要找的人。繼續找下一個
回到家找爸媽（雖然覺得應該是未來的妻子，還是路過一下爸媽的位置觸發劇情吧），夏目為爺爺奶奶那麼年輕感到好開心（媽媽以為這是要給媽媽畫像的作業呢，讓主角畫漂亮點），但是爸媽也不是目標。在這裡家門口可以拿男主的自行車
在便利店找到稲穂（好想念她呀），同為手錶使用者的她還能看到半透明的夏目（以為是新的夥伴妖怪，哈哈），夏目解釋完她是主角未來的女兒後還是慣例的各種慢半拍震驚！當稲穂知道主角在找羈絆之人為了不讓未來的女兒消失，結果一點就理解是要找因為過去而造成未來改變的人，不過依然毫無頭緒的感覺，只能先回大森山看看了。
來到大森山發現主角的同班同學文花（地縛貓向偵探團其他人解釋這是主角喜歡的人把主角急的，哈哈），可能文花就是羈絆之人，不過文花被什麼妖怪附身了，舞步好羞恥啊！
上前掃描可以找到ブリー隊長，這傢伙還記得主角呢，既然不肯解除附身，開戰吧！
戰鬥結束後轉身看到夏目已經快“升天”了，還好文花過來對話以後恢復了原樣，激動過頭的主角上前又是救世主又是女神的表白了，這時夏目才說文花就是她未來的媽媽（不過維斯帕過來強調這事要對主角保密，擔心提前知道了可能會改變未來）。雖然和文花相遇很開心，但是擔心夏目的弟弟得馬上回去香住台看看。
通過門來到未來，老奶奶已經在門口等著了，弟弟已經沒事了，因為太累正在睡覺。奶奶警告：人與人之間的羈絆，如果斷了的話就會出現這麼恐怖的結果，要記住穿越時空去別的世界是伴隨著危險的冒險。
奶奶教育完大家後，大家正要回去休息，忽然預感到有危險但奶奶已經來不及叫住各位了。アクロウ再次襲擊偵探團，這次還布下結界，大家已經沒有退路（カイラ這次也不會出現了），フクロウ揚言：既然大家都那麼累就睡去吧，但是不會再醒過來的那種。
戰勝フクロウ後他吐槽主角：居然把赤鬼打敗了，好殘暴的人類。接著洞潔為了防止アクロウ被打倒使得結界崩壞將アクロウ趕了出去，諷刺了一番トウマ是個不知道幾斤幾兩的小鬼居然敢持有不動王雷鳴劍，妖聖劍不是人類該持有的東西，就像他手上的アシュラ豪炎丸一樣，接著沖過來要搶走雷鳴劍。
將洞潔的血量削到將近一半時發生劇情，トウマ會單挑洞潔（20級左右挺輕鬆的）。將洞潔打敗後他依然不相信人類能將不明動王的力量引出到這種程度，但是為了守護夥伴不明動王將力量借給トウマ，這是人與妖怪的羈絆，傷害夥伴是決不允許的。最後洞潔扔下一堆反派的廢話跑了。
洞潔跑後，トウマ就因為用力過度暈掉了，還好蛇王カイラ幫忙救助。不過雷鳴劍的力量在使用後消失了，暫時無法再憑依。其實也不必再勉強，能將洞潔這樣實力的妖怪打倒已經很厲害了，至於為何他們要來奪取雷鳴劍，經過蛇王的調查發現他們是在妖魔界的黑社會中相當活躍的古鬼族一派。考慮到之前的預言，難道預言中的災禍已經開始了，而且更麻煩的是他們已經得到了與雷鳴劍同樣被列為妖聖劍的アシュラ豪炎丸，那也是被加封了強大力量的武器，除此之外還有三把散落在妖魔界的各地。為了世界得守護剩下的三把聖劍，接下來就是“スザク蒼天斬”，而封印這些劍的地方是與這個世界有特殊的門連著的，根據預言書手錶持有者要前往妖魔界的雙劍山才能找到“スザク蒼天斬”，前去的門就在霧立神社，可能是因為隱藏在神聖的力量裡所以洞潔才沒注意到。趕緊出發吧！
跟著地圖提示掃描到D級的手錶等級門（要進行手錶升級了），大家不明白D的意思時，老奶奶解釋，目前大家的手錶等級是E，只要升一級就能打開這個門了（前三代都做過的事，主角又失憶了？），手錶加強後還會遇到更強的妖怪和不可思議的事件。但是這裡找不到時計屋（原來主角還是記得的），原來老奶奶也精通這個，只是要升級手錶需要接受一個試練（聽奶奶說挺難的），至於為何有試練，是因為手錶等級的提升要與手錶持有者自身的“格”相對應，實力不夠就不能提升。
準備好了就前往老奶奶處對話接受試練，這個試練只是要與某個妖怪“謎之妖怪M”戰鬥，它就在小學校的校園裡。
跟著提示來到校園，原來這個妖怪M真的是個“M”，要與他對戰首先要在隊伍裡將他移出（替換方法攻略最前面有）。主角吐槽這貨怎麼說話的語氣像維斯帕一樣（那一堆廢話就不翻譯啦）。
將他打敗後躺地上裝死想讓夏目安慰鼓勵一下，但夏目直接走了！哈哈哈哈！
回去與奶奶對話即可升級手錶，順便主角的手錶也升級了，D等級的手錶在戰鬥中可以使用必殺技，主角的是攻擊技，夏目的是防守技，接下來還有更多的困難等著我們。加油！
酒吞君這邊得知包圍著雙劍山的霧氣已經散掉，他們也對“スザク蒼天斬”虎視眈眈，並且將トウマ視為重要的威脅，但現在他們首要做的是找到公主和收集妖聖劍。多次失利的アクロウ已經被排除在戰力外，酒吞君顯出真身就把アクロウ嚇跑了。接下來酒吞會和洞潔一起前往雙劍山，劍武魔神的封印要合倆人之力才能打破。
回到奶奶這邊，收到蛇王讓奶奶交給升級了手錶後的各位一把雙劍山之門的鑰匙，手錶升級以後要多調查周圍奇怪的門，然後就準備去雙劍山了。
將門解鎖後開門來到雙劍山，山如其名真的不像是能隨便“登”上去的山，大家疑惑之時忽然來隻大鳥提示如果要拿到劍需要接受挑戰並跟著它走，然後維斯帕在為會說話的鳥感到驚訝，夏目表示比起鳥會說話，妖怪說話才更奇怪好嘛！結果大鳥要發飆了，第三次問究竟要不要挑戰！？トウマ趕緊回到：要！要！挑戰！現在就跟著去！
跟著上前與大鳥對話接受挑戰，然後騎著它前往雙劍山，大鳥指著後面胖的和滿身肌肉的說：你們兩個留下等著（哈哈），因為你們沒有帶手錶而且太胖了！表達決心後，大鳥雖然勉強答應帶上他們，但是強調往前無論遇到什麼都算在試練裡面（感覺會掉下去）。而筋肉那位還是要留下來（夏目表示完全沒問題，之後召喚就好了嘛，但是他還想著和夏目一起空中旅行）。
到達目的地後下鳥，一路往前走，到下一個大鳥的地方對話會再次往上飛，不過這次アキノリ真的掉下去了，然後被救起不過飛到了另一座山，雖然他不會召喚妖怪，太重也沒鳥能馱，只好往上走到對面山能看到的地方去。
一路往前走，中間會有一些地方需要跳過去才能拿到道具，在目的地居然找到一塊妖怪手錶！但是什麼都沒辦法召喚出來（不是要徽章的麼，喂！），正在發愁之時ジュニア被一頭野**到鼻孔裡去了（emmm）。這個豬笹王是妖怪手錶的守護者，ジュニア雖然身陷險境，但說自己還有王牌能一個頂著，讓アキノリ先走。不過豬笹王顯然是想讓アキノリ顯示自己有資格擁有這塊妖怪手錶，アキノリ表示自己是偵探團團長不會扔下同伴逃跑的，手錶立刻產生反應救下ジュニア，然後進入戰鬥。
將豬笹王打敗後，它讓アキノリ前往雙劍山高處的“試練之頂”，並且在那裡有等著アキノリ挑戰的下一個試練。
雖然アキノリ不見蹤影，但維斯帕讓大家相信アキノリ繼續前進，而且大鳥也說過無論遇到什麼事情，那都將是試練的一部分，說不定這是試練。沒有退路的情況下也只好往前走了，在高處可能可以看到アキノリ。
アキノリ這邊信心滿滿，獲得恢復原樣的豬笹王（小豬），獲得瓜坊加入後可以繼續前進了。跟著地圖提示又來到一個大鳥處對話即可繼續往上飛（這次不會掉下去了吧）。
一路往上走會來到最終試煉之地（前面的存檔點記得存檔哦），接下來會遇到麒麟（15級打起來難度不大），將其擊敗後會獲得新世界的鑰匙（還以為是スザク蒼天斬的試練，哈哈），而スザク蒼天斬在對面山頂由另一個守護者把守。アキノリ想提出個請求，麒麟以為還要獎賞（一股怎麼這麼貪心的語氣），但知道他想去對面參加戰鬥則表示願意幫忙並透露アキノリ的手錶是可以召喚出麒麟的特別之物（麒麟：能讓你召喚並讓你使用我的力量你該感到光榮），過去之前貼心地讓他們先行回復（麒麟：你們輸的話太丟我的臉了）。
先跑回復原點進行回復，然後重新與麒麟對話會獲贈麒麟的召喚道具，召喚麒麟的時候會吸取召喚者自身的能量，而且麒麟是負責治癒的（高級奶），都準備好了就出發吧（我還以為麒麟ディスク是個盾牌，沒想到那麼小是用來塞進去手錶的！）。
畫面回到主角這邊，直接就在戰鬥中了，夥伴們正苦戰之時アキノリ趕到（帥哥你誰啊！），互相嘲諷以後アキノリ開始單挑朱雀（X+A召喚麒麟是集體回血大招，要都殘血的時候才好使用）。
戰勝朱雀後受到朱雀的誇獎，一個人推完整個雙劍山的確不錯，但アキノリ強調這個是集體的功勞。接著朱雀將スザク蒼天斬給了トウマ，從此トウマ還可以進行劍武魔神-朱雀的憑依召喚，還將朱雀ディスク交給アキノリ，アキノリ也可以召喚朱雀了，然後就與大鳥對話回去原來的世界吧。
剛下鳥就看到酒吞和洞潔倆人，二話不說就想來搶劍（酒吞責怪洞潔因為之前的事情搞到人類都不怕酒吞了），這次是トウマ一挑二，變身朱雀以後雙刀流沒什麼壓力。
擊敗酒吞倆人後大家用麒麟給的鑰匙開門逃跑（其實不用跑應該能打贏呀，劇情需要）到了一個冰冷的世界。
