| 敵人 | 備註 |
| 餓鬼 | – |
| 妖鬼 | – |
| 猿鬼 | – |
| 獨腳踏韝 | – |
| 河童 | 井裡偶爾會出現，如果之前一直沒拿到的話可以在薄明篇 沖天之魔刷赤河童，是同一種魂核 |
| 敷次郎 | – |
| 泥牆 | 直接攻擊或者是使用姿勢讓泥牆成佛都可以獲得 |
| 鬼火（火） | 三種鬼火的魂核都要分別獲得，可以在旭光篇 滲入的覆水刷。在這個場景有能夠生成鬼火的燈，不打碎就可以一直生成鬼火。 |
| 鬼火（水） | |
| 鬼火（雷） | |
| 亡骸武者 | – |
| 山佬 | – |
| 猥裸 | – |
| 三目八面 | – |
| 濡女 | – |
| 毒黏液 | 這兩種魂核需要分別獲得，毒黏液可以在覺醒篇 蝮蛇神域的最後一個神社附近刷；小海坊主可以在飛翔篇 妖怪一夜城排完水的河底刷 |
| 小海坊主 | |
| 外道兵 | – |
| 油傘妖 | – |
| 禍津武士 | – |
| 琵琶牧牧 | – |
| 貉 | 直接攻擊或者是模仿貉使用同樣的姿勢讓貉離開都可以獲得 |
| 獨眼小僧 | 必須在獨眼小僧變成獨眼鬼之前獲得 |
| 獨眼鬼 | – |
| 巨僧 | 火屬性和水屬性巨僧都是同一種魂核 |
| 輪入道 | 普通輪入道與藍火輪入道都是同一種魂核 |
| 一反木綿 | – |
| 烏鴉天狗 | – |
| 軲轆首 | – |
| 古籠火 | – |
| 姑獲鳥 | – |
| 鐵鼠 | – |
| 生剝鬼 | – |
| 馬頭鬼 | BOSS戰獲得 |
| 牛頭鬼 | – |
| 煙煙羅 | BOSS戰獲得 |
| 夜刀神 | BOSS戰獲得 |
| 鐮鼬 | BOSS戰獲得 |
| 怨靈鬼 | – |
| 祟梟 | BOSS戰獲得 |
| 牛鬼 | BOSS戰獲得 |
| 火車 | BOSS戰獲得 |
| 兩面宿儺 | BOSS戰獲得 |
| 大太法師 | BOSS戰獲得 |
| 酒吞童子 | BOSS戰獲得 |
| 長壁姬 | BOSS戰獲得 |
| 大嶽丸 | BOSS戰獲得 |
| 木靈 | 木靈魂核攻略 |
| 善擦 | 善擦消失的時候有一定幾率獲得 |
| 禦靈（紅） | 一些擁有守護靈的人形BOSS有幾率掉落，需要分別獲得 |
| 禦靈（藍） | |
| 禦靈（紫） |
大部分魂核都在打敗敵人之後會有幾率掉落，一些需要注意的魂核可以參照上表。可以在神社選擇奉納來提升魂核的掉落率，守護靈可以選擇白澤，附帶了8%提升的魂核掉落率，沒獲得的話可以用白蝮。之後再搭配增加掉落魂核的魂核，盡可能的提升魂核的掉落率即可。
