3.餐廳區域、演奏廳樓層 9.魔術樓層
6.攝影棚樓層 12.迪斯可樓層、最終決戰
海灘餐廳樓層
12層
一路向左，調查船隻後會收到來自哎喲喂博士的電話，讓路易吉先回實驗室。按照要求先返回。
B1層
實驗室中博士所給的視頻可發現，奇諾比奧是在B2失蹤的，按要求前往B2尋找。
B2層
一路前進會觸發多次戰鬥，前往奇諾比奧失蹤的「倉庫」，在裡面用ZR+ZL撞開會動的紙皮箱可以發現奇諾比奧。然後用傀易吉把它吸住，噴射到牆壁另外一邊即可。
帶著奇諾比奧來到門外面，他就會告訴路易吉零件的位置。和奇諾比奧一人站在一個按鈕上把機關弄出來，然後傀易吉用吸塵器把路易吉運送到對岸，再用路易吉把奇諾比奧發射上去拿到零件（即使射歪了也不用擔心，蘑菇頭會直接傳送回玩家身邊）。
然而回去的路上被一隻巨大的氣呼呼擋住，向右前進，用吸塵器把奇諾比奧向上面的救生樓梯打過去，他就會把樓梯拉下來。
繼續一路從下水道部分前進，沿途消滅擋路的幽靈，跟隨奇諾比奧來到排水控制室的水路內。直接吸住奇諾比奧，噴射把牆壁擊碎即可前進。
用亮光燈照亮開關後，把奇諾比奧射上頂部取得閥門轉盤。
進入舊儲水場，下樓用奇諾比奧把牆壁擊破，然後讓傀易吉站在下面的開關上，把奇諾比奧發射到上面的開關上，即可弄出發動機。用吸塵器啟動發動機即可調整過道的位置前進。
順著一路來到閥門室地下，然後向外離開，最後利用奇諾比奧擊飛救生樓梯即可逃離。
吸塵器強化後即可再返回12層繼續探索。
12層
調查左邊的插座，即可直接用大威力吸塵器拆除掉擋路的海盜船。
進入洞窟咖啡廳，一路前進到骷髏頭內部的海灘區域，到海港上拉扯鈴鐺觸發劇情進入海盜船BOSS戰。
吸引旁邊的小嘍囉扔出來的炸彈，往BOSS嘴裡扔進去，反復3次後它就會出來，然後引誘其攻擊，在其大攻擊鉤子卡在地板的時候才可以照射它令它產生硬直，再才可以吸取。
反復攻擊令其剩下100血之後，它就會更換攻擊模式，當它傾斜整個海盜船的時候，對著右邊的靶發射吸盤將自己拉住避免掉下去。然後小嘍囉就會扔出炸彈，和剛剛同樣的方法，將炸彈投入到它的嘴裡，反復3次它就會再次將船傾斜，繼續使用吸盤拉住靶避免掉下去。
本體顯型後會增加一招在地面潛行咬，使用ZR+ZL彈跳躲避。成功引誘他出現破綻後即可戰勝它。
