在酋長資料片裡新增了3個來自美洲的文明。易洛魁是生活在美國東北部和加拿大地區的土著民族，在16世紀曾擁有相當大的勢力，在美國獨立戰爭中分裂；蘇族是生活在美國西部大平原上的遊牧民族，以強大的騎兵和與美國政府軍的戰鬥而聞名；阿茲特克在前作帝國2里已經出現，不過新作裡的阿茲特克內容更加豐富。決定版加入印加人。
元首：海華沙
易洛魁是強大的快攻民族，前期升級快速且免費贈送的雪橇可以方便的前置作戰小屋，既能生產步兵又能接受支援，能快速將戰火燒到敵人家中，是帝國3的快攻強國；而中期雪橇又能方便轉化成農田、種植園等各種建築，節省了大量木材和工作時間。易洛魁的酋長增加部隊15%生命值，極大增強了部隊的戰鬥能力。易洛魁步兵實力強大，無論是冷兵器的擲斧兵和弓箭手，還是可隱身的森林徘徊者，都是相當精悍的兵種，並擁有一系列加強卡片和酋長生命值光環加成，堪稱遊戲中最強的步兵國。易洛魁的攻城武器同樣強悍，遠防高的防彈盾牌，拆房極快的攻城錘，以及工業時代擁有的既能作戰又能反炮的輕型加農炮，都是攻城武器中的佼佼者。
城市：卡納瓦加
獨特部隊：艾那弓箭手、擲斧兵、坎亞騎兵、輕型加農炮、森林徘徊者（隱身散兵）、攻城錘、易洛魁盾牌手
優勢部隊：艾那弓箭手、輕型加農炮、森林徘徊者（隱身散兵）、擲斧兵
獨特建築：長屋（人口15）
元首：誇烏特莫克
阿茲特克是唯一一個純步兵民族，但步兵種類豐富，既可強經濟又可強軍事，戰術多樣性不遜於任何一個國家。阿茲特克既能憑藉前期實用的土狼游擊兵、投石兵以及性價比超群的美洲獅長槍兵發動致命快攻，又能通過火舞生產10個戰鬥祭祀，從而在不影響正常經濟發展的情況下就擁有相當於另兩個土著20農跳舞的各項加成。後期阿茲特克的弓箭武士、雄鷹游擊武士和美洲虎徘徊武士同樣性價比不俗，而稀有卻強大的骷髏武士的攻擊力更是驚豔，打卡後範圍攻擊高達3格，近身作戰威力強大。阿茲特克的農業科技發達，擁有一系列農田生產速度加強。此外阿茲特克的海戰實力同樣強大，擁有性價比極高的雨神獨木舟，雖然射箭但威力卻比歐洲的炮艦更驚人，是遊戲中最強的海戰民族之一。
城市：鐵諾奇帝蘭
獨特部隊：土狼游擊兵、投石兵、美洲獅長槍兵、戰鬥祭司、雄鷹游擊武士、美洲虎徘徊武士、弓箭武士、骷髏武士、雨神獨木舟
優勢部隊：骷髏武士、美洲虎徘徊武士、弓箭武士、雨神獨木舟
獨特建築：貴族小屋
元首：高爾
蘇族是遊戲裡的騎兵民族之王，前期擁有速度優勢的騎兵配合酋長可以騷擾對手，而後期種類繁多加強卡全面的混編騎兵又擁有強大的作戰能力，是唯一可以純騎兵作戰的民族，當然蘇族的步兵實力也不差。蘇族是大平原上的優秀獵人，擁有打獵速度的加成，並通過主城和升級獲得大量野牛，提供豐富的食物來源，但其他經濟加強卡極度匱乏，後期經濟實力墊底。蘇族的印第安帳篷雖然不提供人口，但打卡後可以增加附近部隊的生命值和攻擊力且效果疊加，使得蘇族陣地戰同樣威力強大。
城市：洪克帕帕
獨特部隊：鷹神弓兵、持棍戰士、斧騎兵、狼騎兵、弓騎兵、步槍騎兵、塔斯雲坎徘徊者（隱身近戰騎兵）、瓦齊納步槍手、戰士（火舞祭典）
優勢部隊：瓦齊納步槍手、狼騎兵、弓騎兵、步槍騎兵
獨特建築：印第安帳篷（可以增加附近單位的生命值）
