《實況2016》與《實況2015》的系統菜單也是一致的，都類似於WIN8、WIN10的貼齊。
首頁菜單
杯賽：《PES2016》已經雄霸各大杯賽，這些杯賽會隨機出現在這裡。
展示賽事：相當於是快速比賽，玩家可以選擇《實況足球》獲得授權的賽事進行快捷比賽(可以選擇西甲聯賽、歐冠、亞冠等)。
大師聯賽：進行聯網的大師聯賽。
我的俱樂部：快速進入我的俱樂部(聯網的教練模式)。
快捷入口：在首頁菜單第一項是快捷遊戲入口，玩家可以點選它進入對上一次遊戲的內容，譬如之前是進行技巧訓練，那麼快捷入口就會變成技巧訓練。
設置菜單
比賽畫面設定
開啟雷達顯示：選擇在何處戰士球場概況，顯示足球和隊員位置的雷達;
玩家姓名牌：選擇是否在畫面底部顯示計量表和球員姓名;
雷達點顏色(主場)：選擇球員圓點的顏色;
雷達點顏色(客場)：選擇球員圓點的顏色;
能量顯示條：選擇是否顯示踢球和擲邊線球的力度計;
光標顯示：選擇比賽中是否在球員上方顯示光標;
體力刻度表：顯示球員在比賽中的體能消耗，體能就快耗盡時，體力刻度表會變成紅色;
時間/得分：選擇是否顯示比分和比賽進行時間;
戰術：選擇是否在比賽中顯示所選的默認戰術;
通用控制的球員姓名：選擇是否在計算機控制隊員頭頂顯示名字;
定位球指南：選擇是否在定位球時顯示控制指南;
音效設定
菜單屏幕SFX：選擇不同的音效音量，包括光標的聲音;
背景音樂音量：選擇BGM音量、回放以及主菜單音量;
旁述音量：選擇旁述者的音量;
球迷聲：選擇球迷聲量的音量;
PA廣播：選擇廣播音量的大小;
體育館音樂：選擇體育館音量;
球場聲音：選擇球場聲音音量;
遊戲速度
遊戲速度：調整比賽中的遊戲速度;
語言選擇
遊戲內文字：調整遊戲顯示的語言文字;
評述語言：選擇評述者的語言;
個人數據編輯
(最多可以開設32嗰檔案格)
個人數據名稱：修改個人數據名稱;
按鍵配置：設置手柄、鍵盤鍵位;
游標變更：改為固定光標、輔助或半輔助;
光標名稱：選擇比賽中是否在球員上方顯示光標;
傳球支援度：從五個等級中設定傳球時球員自動接應傳球程度。
空位傳球類型：標準控制，傳球支援度會做出相應反應;
射門類型：可以選擇基本、進階、手動，變更射門的輔助效果;
任意球操控：球踢出弧線偏離方向的選擇;
方向指示：開啟或關閉;
目標指示：開啟或關閉;
定位指示：開啟或關閉;
自動假動作：開啟或關閉(根據球員移動的方向，輕鬆拉求技巧控制將被選定);
自動滑鏟：隊中的球員在嘗試將求贏回來時，會偶爾使用飛神鏟球;
隊友控制：你可以令球隊的另一名球員向對手方向跑去;
聲軌
選擇播放遊戲內的背景音樂。
與電腦對戰的記錄
查看與電腦對戰的記錄，當中記錄了場次、勝場、擺場、平手、勝率、連勝、得分、失球、總射門等。
查看DLC以及遊戲版本
可以查看已經下載的DLC內容以及目前遊戲的更新版本。
